转录因子调控
方法：把转录因子、结构基因和代谢物串成调控假设。
结果：221 个转录因子与代谢物存在 5,364 对高相关；17,807 条三元组里的基因和代谢物有已知反应支持，其中 130 条有中介提示。
方法：把转录因子、结构基因和代谢物串成调控假设。
结果：221 个转录因子与代谢物存在 5,364 对高相关；17,807 条三元组里的基因和代谢物有已知反应支持，其中 130 条有中介提示。
提出可验证的调控假设。
注释为转录因子且表达过滤后的基因；代谢通路基因；全部代谢物。
① TF × 代谢物相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）；② GENIE3 随机森林推断 TF → 代谢通路基因（30 样本，500 棵树）；③ 三元组：TF-基因 |r|≥0.8，基因-代谢物为已知反应或 Tier1；④ 控制基因后 TF-代谢物相关下降一半以上，记为中介提示。
这些都是统计假设，没有序列和互作证据，不能说明直接调控，需要实验验证（酵母单杂、EMSA、瞬时表达等）。
注：颜色是 log2(差异 TF 数+1)，显示数量最多的 40 个家族。
注：颜色是高相关配对数的 log2 值。
注：取 GENIE3 权重最高的 40 条有已知反应支持的三元组。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
tf 转录因子基因；family TF 家族；name 代谢物；class1 类别；r 为 30 样本 Pearson 相关；fdr 为 BH 校正值。
注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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注：菱形=差异转录因子，方形=差异代谢物，红线正相关，蓝线负相关（|r|≥0.8，FDR<0.05）。只表示相关，不代表直接调控。
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