相关基因富集
对与代谢物高相关的基因做 KEGG / GO 富集,看这些基因主要参与哪些功能。
主要发现:全局 8,100 个高相关基因中 KEGG 有 6 条、GO 有 37 项 FDR<0.05,以光合作用相关条目为主;48 个 Tier1 基因的 KEGG 富集没有显著条目。
对与代谢物高相关的基因做 KEGG / GO 富集,看这些基因主要参与哪些功能。
主要发现:全局 8,100 个高相关基因中 KEGG 有 6 条、GO 有 37 项 FDR<0.05,以光合作用相关条目为主;48 个 Tier1 基因的 KEGG 富集没有显著条目。
n 命中基因数;bg 该条目背景基因数;k 有注释的输入基因数;U 背景总数;p 超几何检验 P;fdr 该次检验全部条目内 BH 校正;ids 命中基因。
FDR<0.05 共 37 项,涉及 1236 个基因。n 命中基因数;bg 该条目背景基因数;k 有注释的输入基因数;U 背景总数;p 超几何检验 P;fdr 该次检验全部条目内 BH 校正;ids 命中基因。
没有 FDR<0.05 的条目。n 命中基因数;bg 该条目背景基因数;k 有注释的输入基因数;U 背景总数;p 超几何检验 P;fdr 该次检验全部条目内 BH 校正;ids 命中基因。
FDR<0.05 的 39 项只涉及 17 个不同基因,多项由同一批基因带动(常见于注释相同的同源基因),只作提示。n 命中基因数;bg 该条目背景基因数;k 有注释的输入基因数;U 背景总数;p 超几何检验 P;fdr 该次检验全部条目内 BH 校正;ids 命中基因。