差异总览
方法:汇总 45 个比较的差异基因和差异代谢物。
结果:差异基因 3–6,801 个,最多的是 R3_vs_Y5;差异代谢物 9–237 个,最多的是 R4_vs_Y3。水平 1–3 内部几乎没有差异。



方法:汇总 45 个比较的差异基因和差异代谢物。
结果:差异基因 3–6,801 个,最多的是 R3_vs_Y5;差异代谢物 9–237 个,最多的是 R4_vs_Y3。水平 1–3 内部几乎没有差异。



看每个比较的变化规模,判断后续分析的可信范围。
差异基因表(45 个比较);差异代谢物表(25 个服务商比较 + 20 个补算比较)。
计数、类别统计、集合交集(UpSet)、双组学火山图。
差异分子很少的比较,后续通路和模型结果不稳定,解读要谨慎。
注:红=上调,蓝=下调,方向为后一组相对前一组。
注:每个点是一个比较,颜色为比较类别。
注:行是代谢物一级分类,列是比较,数字是差异代谢物数量,颜色为 log2(数量+1)。
注:下方点阵表示比较组合,上方柱是只属于该组合的差异分子数,最多显示 30 个组合。
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注:下方点阵表示比较组合,上方柱是只属于该组合的差异分子数,最多显示 30 个组合。
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注:下方点阵表示比较组合,上方柱是只属于该组合的差异分子数,最多显示 30 个组合。
注:左为基因,右为代谢物。横坐标是 log2 差异倍数,正值表示后一组更高;纵坐标是显著性,基因用校正后 P,代谢物用 P。红、蓝分别是上调和下调。
注:左为基因,右为代谢物。横坐标是 log2 差异倍数,正值表示后一组更高;纵坐标是显著性,基因用校正后 P,代谢物用 P。红、蓝分别是上调和下调。
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注:左为基因,右为代谢物。横坐标是 log2 差异倍数,正值表示后一组更高;纵坐标是显著性,基因用校正后 P,代谢物用 P。红、蓝分别是上调和下调。
注:左为基因,右为代谢物。横坐标是 log2 差异倍数,正值表示后一组更高;纵坐标是显著性,基因用校正后 P,代谢物用 P。红、蓝分别是上调和下调。
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