KEGG 通路图
方法:把每个比较的差异基因和差异代谢物画到同一张 KEGG 图上。
结果:共 880 张通路图,45 个比较各 1 张全局代谢图,颜色深浅表示 log2FC 大小。选择比较后,点通路名打开。
全局结果
各通路有着色图的比较数(73 条通路)下载全表| pid | name | n_maps | n_joint_sig |
|---|
| 00941 | Flavonoid biosynthesis | 34 | 18 |
| 02010 | ABC transporters | 32 | 0 |
| 00400 | Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis | 30 | 1 |
| 00052 | Galactose metabolism | 30 | 0 |
| 00053 | Ascorbate and aldarate metabolism | 26 | 3 |
| 00940 | Phenylpropanoid biosynthesis | 25 | 15 |
| 00630 | Glyoxylate and dicarboxylate metabolism | 25 | 4 |
| 00999 | Biosynthesis of various plant secondary metabolites | 25 | 1 |
| 00960 | Tropane, piperidine and pyridine alkaloid biosynthesis | 24 | 8 |
| 00240 | Pyrimidine metabolism | 24 | 0 |
| 00270 | Cysteine and methionine metabolism | 23 | 1 |
| 00920 | Sulfur metabolism | 21 | 0 |
| 00944 | Flavone and flavonol biosynthesis | 21 | 0 |
| 00040 | Pentose and glucuronate interconversions | 20 | 13 |
| 00950 | Isoquinoline alkaloid biosynthesis | 19 | 7 |
| 00360 | Phenylalanine metabolism | 19 | 6 |
| 00500 | Starch and sucrose metabolism | 18 | 5 |
| 00380 | Tryptophan metabolism | 18 | 3 |
| 00230 | Purine metabolism | 18 | 0 |
| 00300 | Lysine biosynthesis | 18 | 0 |
| 00908 | Zeatin biosynthesis | 18 | 0 |
| 00130 | Ubiquinone and other terpenoid-quinone biosynthesis | 17 | 9 |
| 00350 | Tyrosine metabolism | 17 | 8 |
| 00520 | Amino sugar and nucleotide sugar metabolism | 16 | 2 |
| 00790 | Folate biosynthesis | 16 | 0 |
| 00020 | Citrate cycle (TCA cycle) | 15 | 0 |
| 00564 | Glycerophospholipid metabolism | 15 | 0 |
| 00600 | Sphingolipid metabolism | 14 | 2 |
| 00260 | Glycine, serine and threonine metabolism | 14 | 0 |
| 00470 | D-Amino acid metabolism | 13 | 0 |
| 04082 | Neuroactive ligand signaling | 13 | 0 |
| 00740 | Riboflavin metabolism | 11 | 0 |
| 00310 | Lysine degradation | 10 | 0 |
| 00410 | beta-Alanine metabolism | 10 | 0 |
| 00460 | Cyanoamino acid metabolism | 10 | 0 |
| 00770 | Pantothenate and CoA biosynthesis | 10 | 0 |
| 00010 | Glycolysis / Gluconeogenesis | 9 | 0 |
| 00330 | Arginine and proline metabolism | 9 | 0 |
| 00561 | Glycerolipid metabolism | 9 | 0 |
| 00660 | C5-Branched dibasic acid metabolism | 9 | 0 |
| 00750 | Vitamin B6 metabolism | 9 | 0 |
| 00591 | Linoleic acid metabolism | 8 | 4 |
| 00340 | Histidine metabolism | 8 | 0 |
| 00942 | Anthocyanin biosynthesis | 8 | 0 |
| 00945 | Stilbenoid, diarylheptanoid and gingerol biosynthesis | 8 | 0 |
| 00970 | Aminoacyl-tRNA biosynthesis | 8 | 0 |
| 00480 | Glutathione metabolism | 6 | 1 |
| 00220 | Arginine biosynthesis | 6 | 0 |
| 00250 | Alanine, aspartate and glutamate metabolism | 6 | 0 |
| 00280 | Valine, leucine and isoleucine degradation | 6 | 0 |
| 00290 | Valine, leucine and isoleucine biosynthesis | 6 | 0 |
| 00566 | Sulfoquinovose metabolism | 6 | 0 |
| 00541 | Biosynthesis of various nucleotide sugars | 5 | 1 |
| 00051 | Fructose and mannose metabolism | 5 | 0 |
| 00430 | Taurine and hypotaurine metabolism | 5 | 0 |
| 00562 | Inositol phosphate metabolism | 5 | 0 |
| 00901 | Indole alkaloid biosynthesis | 4 | 2 |
| 00061 | Fatty acid biosynthesis | 4 | 0 |
| 00261 | Monobactam biosynthesis | 4 | 0 |
| 00780 | Biotin metabolism | 4 | 0 |
| 00904 | Diterpenoid biosynthesis | 4 | 0 |
| 00195 | Photosynthesis | 3 | 3 |
| 00030 | Pentose phosphate pathway | 3 | 0 |
| 00190 | Oxidative phosphorylation | 3 | 0 |
| 00670 | One carbon pool by folate | 3 | 0 |
| 00710 | Carbon fixation by Calvin cycle | 3 | 0 |
| 04142 | Lysosome biogenesis | 3 | 0 |
| 04148 | Efferocytosis | 3 | 0 |
| 00650 | Butanoate metabolism | 2 | 0 |
| 00785 | Lipoic acid metabolism | 2 | 0 |
| 00966 | Glucosinolate metabolism | 2 | 0 |
| 04070 | Phosphatidylinositol signaling system | 2 | 0 |
| 00071 | Fatty acid degradation | 1 | 0 |
各比较结果
KEGG 通路图
分析目的
在通路结构上看基因和代谢物的对应关系。
输入数据
第 05 步的共映射通路;KEGG 底图和 KGML 坐标。
分析方法
只画至少含 1 个差异基因和 1 个差异代谢物的通路。
结果怎么看
方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。
各通路有着色图的比较数(73 条通路)
n_maps 画了着色图的比较数(该比较两边都有差异分子,且 KEGG 有底图);n_joint_sig 其中联合显著的比较数。下载的是全部通路图清单。某条通路在各比较中的图,在下方选择比较后打开。
R1_vs_Y1 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R1_vs_Y1 共映射通路(14 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R2_vs_Y2 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R2_vs_Y2 共映射通路(13 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R3_vs_Y3 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R3_vs_Y3 共映射通路(14 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R4_vs_Y4 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R4_vs_Y4 共映射通路(24 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R5_vs_Y5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R5_vs_Y5 共映射通路(29 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R1_vs_R4 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R1_vs_R4 共映射通路(8 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R1_vs_R5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R1_vs_R5 共映射通路(21 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R2_vs_R4 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R2_vs_R4 共映射通路(8 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R2_vs_R5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R2_vs_R5 共映射通路(14 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R3_vs_R4 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R3_vs_R4 共映射通路(21 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R3_vs_R5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R3_vs_R5 共映射通路(26 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R4_vs_R5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R4_vs_R5 共映射通路(8 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
Y1_vs_Y3 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
Y1_vs_Y3 共映射通路(1 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
Y1_vs_Y4 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
Y1_vs_Y4 共映射通路(33 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
Y1_vs_Y5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
Y1_vs_Y5 共映射通路(25 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
Y2_vs_Y4 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
Y2_vs_Y4 共映射通路(19 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
Y2_vs_Y5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
Y2_vs_Y5 共映射通路(14 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
Y3_vs_Y4 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
Y3_vs_Y4 共映射通路(25 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
Y3_vs_Y5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
Y3_vs_Y5 共映射通路(22 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
Y4_vs_Y5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
Y4_vs_Y5 共映射通路(5 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R1_vs_Y2 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R1_vs_Y2 共映射通路(12 张,点通路名打开)
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R1_vs_Y3 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R1_vs_Y3 共映射通路(13 张,点通路名打开)
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R1_vs_Y4 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R1_vs_Y4 共映射通路(33 张,点通路名打开)
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R1_vs_Y5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R1_vs_Y5 共映射通路(32 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R2_vs_Y1 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R2_vs_Y1 共映射通路(10 张,点通路名打开)
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R2_vs_Y3 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R2_vs_Y3 共映射通路(26 张,点通路名打开)
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R2_vs_Y4 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R2_vs_Y4 共映射通路(16 张,点通路名打开)
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R2_vs_Y5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R2_vs_Y5 共映射通路(31 张,点通路名打开)
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R3_vs_Y1 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R3_vs_Y1 共映射通路(12 张,点通路名打开)
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R3_vs_Y2 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R3_vs_Y2 共映射通路(13 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R3_vs_Y4 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R3_vs_Y4 共映射通路(38 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R3_vs_Y5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R3_vs_Y5 共映射通路(29 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R4_vs_Y1 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R4_vs_Y1 共映射通路(31 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R4_vs_Y2 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R4_vs_Y2 共映射通路(30 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R4_vs_Y3 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R4_vs_Y3 共映射通路(41 张,点通路名打开)
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R4_vs_Y5 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R4_vs_Y5 共映射通路(32 张,点通路名打开)
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R5_vs_Y1 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R5_vs_Y1 共映射通路(36 张,点通路名打开)
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R5_vs_Y2 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R5_vs_Y2 共映射通路(37 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。
R5_vs_Y3 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R5_vs_Y3 共映射通路(37 张,点通路名打开)
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R5_vs_Y4 全局代谢图
注:底图为 KEGG 全局代谢图 map01100。线条是差异基因对应的反应,圆点是差异代谢物,只画差异节点。颜色是 log2FC,以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;紫色边框=同一化合物上下调都有。
R5_vs_Y4 共映射通路(27 张,点通路名打开)
点击通路名打开着色通路图,点“表格”打开该图的逐节点数据。方框=基因,圆点=代谢物。差异节点按 log2FC 连续着色:以 0 为中心,红=上调,蓝=下调,颜色越深差异越大,超过 ±5 按 ±5 显示;同一节点取差异分子 log2FC 的中位数。浅灰色=已检出但无显著差异;白色=未检出,或本项目没有对应分子,这类节点没有 log2FC。紫色边框=该节点上下调都有;粗黑边框=差异分子在一组未检出,log2FC 是用检出下限估算的。图上方两个色标分别对应基因和代谢物,范围相同。nodes_gene、nodes_met 是图上的差异节点数,可能少于差异分子数,因为多个分子可落在同一节点。