相关热图与网络
方法:展示每个比较通过阈值的基因-代谢物配对。
结果:45 个比较各有热图、网络、弦图、联合表达热图;差异分子过少的比较会注明。
方法:展示每个比较通过阈值的基因-代谢物配对。
结果:45 个比较各有热图、网络、弦图、联合表达热图;差异分子过少的比较会注明。
直观展示核心配对,并给出可导入 Cytoscape 的网络文件。
第 08 步的配对结果。
优先选 Tier1,再按相关强度选取。图上数量有限制,全部配对保存在数据文件。
网络里连接多的节点值得关注,但这些连接大多由组间差异驱动,要结合 Tier 和已知反应判断。
注:行是基因,列是代谢物,颜色是 30 样本 Pearson r,白色表示这一对未通过阈值。优先选 Tier1,再按相关强度和连接数选取,最多各 50 个。
注:圆形=基因,方形=代谢物,点越大连接越多;红线正相关,蓝线负相关。图上最多 300 条边,全部节点和边见数据文件,可导入 Cytoscape。
注:蓝色扇区是基因,橙色扇区是代谢物,连线为相关最强的 60 对;红线正相关,蓝线负相关。
注:列是该比较 6 个样本,行是入选的基因和代谢物,颜色是行 z-score。
注:行是基因,列是代谢物,颜色是 30 样本 Pearson r,白色表示这一对未通过阈值。优先选 Tier1,再按相关强度和连接数选取,最多各 50 个。
注:圆形=基因,方形=代谢物,点越大连接越多;红线正相关,蓝线负相关。图上最多 300 条边,全部节点和边见数据文件,可导入 Cytoscape。
注:蓝色扇区是基因,橙色扇区是代谢物,连线为相关最强的 60 对;红线正相关,蓝线负相关。
注:列是该比较 6 个样本,行是入选的基因和代谢物,颜色是行 z-score。
注:行是基因,列是代谢物,颜色是 30 样本 Pearson r,白色表示这一对未通过阈值。优先选 Tier1,再按相关强度和连接数选取,最多各 50 个。
注:圆形=基因,方形=代谢物,点越大连接越多;红线正相关,蓝线负相关。图上最多 300 条边,全部节点和边见数据文件,可导入 Cytoscape。
注:蓝色扇区是基因,橙色扇区是代谢物,连线为相关最强的 60 对;红线正相关,蓝线负相关。
注:列是该比较 6 个样本,行是入选的基因和代谢物,颜色是行 z-score。
注:行是基因,列是代谢物,颜色是 30 样本 Pearson r,白色表示这一对未通过阈值。优先选 Tier1,再按相关强度和连接数选取,最多各 50 个。
注:圆形=基因,方形=代谢物,点越大连接越多;红线正相关,蓝线负相关。图上最多 300 条边,全部节点和边见数据文件,可导入 Cytoscape。
注:蓝色扇区是基因,橙色扇区是代谢物,连线为相关最强的 60 对;红线正相关,蓝线负相关。
注:列是该比较 6 个样本,行是入选的基因和代谢物,颜色是行 z-score。
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注:圆形=基因,方形=代谢物,点越大连接越多;红线正相关,蓝线负相关。图上最多 300 条边,全部节点和边见数据文件,可导入 Cytoscape。
注:蓝色扇区是基因,橙色扇区是代谢物,连线为相关最强的 60 对;红线正相关,蓝线负相关。
注:列是该比较 6 个样本,行是入选的基因和代谢物,颜色是行 z-score。
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注:圆形=基因,方形=代谢物,点越大连接越多;红线正相关,蓝线负相关。图上最多 300 条边,全部节点和边见数据文件,可导入 Cytoscape。
注:蓝色扇区是基因,橙色扇区是代谢物,连线为相关最强的 60 对;红线正相关,蓝线负相关。
注:列是该比较 6 个样本,行是入选的基因和代谢物,颜色是行 z-score。
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注:蓝色扇区是基因,橙色扇区是代谢物,连线为相关最强的 60 对;红线正相关,蓝线负相关。
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注:列是该比较 6 个样本,行是入选的基因和代谢物,颜色是行 z-score。
注:行是基因,列是代谢物,颜色是 30 样本 Pearson r,白色表示这一对未通过阈值。优先选 Tier1,再按相关强度和连接数选取,最多各 50 个。
注:圆形=基因,方形=代谢物,点越大连接越多;红线正相关,蓝线负相关。图上最多 300 条边,全部节点和边见数据文件,可导入 Cytoscape。
注:蓝色扇区是基因,橙色扇区是代谢物,连线为相关最强的 60 对;红线正相关,蓝线负相关。
注:列是该比较 6 个样本,行是入选的基因和代谢物,颜色是行 z-score。